Un sistema d'electroforesi consta de dos components principals: una font d'alimentació i una cambra d'electroforesi. La font d'alimentació subministra energia. El "poder", en aquest cas, és l'electricitat. L'electricitat que prové de la font d'alimentació flueix, en una direcció, d'un extrem a l'altre de la cambra d'electroforesi. El càtode i l'ànode de la cambra són els que atrauen les partícules de càrrega oposada.
Dins de la cambra d'electroforesi, hi ha una safata, més precisament, una safata de fosa. La safata de colada consta de les següents parts: placa de vidre que va al fons de la safata de colada. El gel es manté a la safata de fosa. La "pinta" s'assembla al seu nom. La pinta es col·loca a les ranures del costat de la safata de colada. Es posa a les ranures ABANS d'abocar el gel calent i fos. Quan el gel es solidifica, es treu la pinta. Les "dents" de la pinta deixen petits forats al gel que anomenem "pous". Els pous es fan quan el gel calent i fos es solidifica al voltant de les dents de la pinta. La pinta s'extreu després que el gel s'hagi refredat, deixant pous. Els pous proporcionen un lloc per posar les partícules que voleu provar. Una persona ha de tenir molta cura de no trencar el gel en carregar les partícules. El trencament o el trencament del gel probablement afectaran els vostres resultats.